Le 05 Janvier 1961 le "Marsouin" quitte Lorient pour une croisière de longue durée avec au programmes des exercices avec l'escadre légère et une escale à Mers-el-Kébir le 27 et 28 Janvier.

Le "Marsouin" à  Mers-el-Kébir

Puis direction les Canaries où il est en mission de représentation du 08 au 12 Février à Santa Cruz de Tenerife. Retour à Lorient le 01 Mars après 54 jours de croisière.

Arrivée à Kéroman le 08 Mars des sous-marins britanniques H.M.S. "Taciturn", H.M.S. "Tudor" et H.M.S. "Trenchant". Ils vont participer avec le "Marsouin" et le "Roland Morillot" à l'exercice interallié « Dawn-Breeze VI ». Le 17 Mars fin de la première partie de l'exercice. La seconde partie se déroule la semaine suivante.

Du 12 au 31 Mai le "Marsouin", le "Narval" et le "Roland-Morillot" participent à un exercice de lutte anti-sous-marine, dans les environs de Brest et de Lorient. Il y a également les escorteurs d'escadre "Casabianca" et "Du Chayla" ainsi que des appareils de la 23, 24  et 25 F.

À partir de mi-Juin il participe à la « Croisière d'été de l'Escadre légère » dans les pays nordiques. Il fait escale à Bergen (Norvège) du 23 au 27 Juin, à Cuxhaven (Allemagne) du 01 au 06 Juillet et du 08 au 11 Juillet à Amsterdam (Pays-Bas), puis du 13 au 17 Juillet à Cherbourg, puis retour à Lorient.

En Octobre, il effectue une croisière en Mer du Nord, fait escale à Invergorden (Écosse) le 13 et ensuite participe à l'exercice « Sharp Squall » et fait relâche du 27 au 30 à Rosyth. Retour à Lorient le 31 Octobre.

Le lendemain il appareille en direction de Bordeaux où il arrive le 04 Novembre. Il y reste en escale jusqu'au 07. Il participe par la suite à un exercice avec l'aéronavale, puis retrouve Kéroman le 17 Novembre. (Article du Cols Bleus n°721).

Le 18 Novembre le Lieutenant de Vaisseau Joli prend le commandement du "Marsouin" après celui du "Roland-Morillot".

De Janvier à Septembre 1962, le "Marsouin" est de nouveau en I.P.E.R. (Indisponibilité Périodique Et Réparations).

Le 08 Novembre il appareille de Lorient, retour le 17.

Le 21 Juin 1963 le Capitaine de Corvette Le Poittevin de Lacroix de Vaubois prend le commandement du "Marsouin".

Le 10 Septembre 1963 le Q.M. Électricien Bertinchant se blesse à bord du "Marsouin", il est grièvement blessé. (Article Cols Bleus n°812).

Départ de Lorient, puis retour le 30 Septembre.

Départ de Lorient, puis retour le 08 Novembre.

Départ de Lorient, puis retour le 18 Novembre.

Départ de Lorient, puis retour le 22 Novembre.

Le 02 Décembre appareillage de Lorient, puis retour.

Départ de Lorient le 09 Décembre, puis retour.

Départ de Lorient le 16 Décembre puis retour le 19.